W serwisie Booking.com for Business wszystkie płatności muszą być dokonywane kartą. Akceptowane są karty Amex, Mastercard, Visa, AirPlus i Diners Club International.
Można korzystać z firmowej karty (dla wszystkich podróżujących) lub osobistych kart (tylko do użytku prywatnego). Można zapisać na swoim koncie aż cztery karty, co zapewnia elastyczność w opłacaniu różnych elementów podróży (lotów, zakwaterowania, transportu) różnymi kartami.